Genome file:  temp/burkholderia_strain.txt
Sequence Header:  >Contig22


Genome file:  temp/burkholderia_strain.txt
Sequence Header:  >Contig23

>PredictedProphage1-Hit1
APQTAPVKLYRVAEVSKMLGVCRATVYNLVRDGKLTLVKIGKRSSGITAASVEALVSGASEGK
>PredictedProphage1-Hit2
ALGSVYSLYAADDSGNLAAGSLAFQVTRTGSSPSALQTVSVQPYTDNAFPCGAAGFRWSVVYAATGVINTSDENQKEQIEGIPDAWLDAWADVDYFAFKFKDATAEKGADNARWHVGFVAQRVRDAFAKHGIDAAKIGLLCWDSWPAQSAVLDDEGNVIKPAIDAGEAWGIR
>PredictedProphage1-Hit3
MTVTSSAQDISYATDGATTDFQIPFYFLDNAHIVVDKIDANGGLTRLTYGTDFTVGGAGAVNGGTLTALSVFARGFTLHIYRDVPATQETEYQQNDPFPAKTTEKALDKLTMIAQQNAAATQNSIRFPISEYGRDGTLPSAPQRAMNVLGFDVAGNVTMLPVPASVGAGDLRDDILVAGVDFIAGVDSSVTLSRAYGTKANLTVSMDAALQGADTFRLNGATLTFLDDNGNPAAIPFGIQKIYVKGGTTLSIYTPPDESVTDAKIAPGSKLDNRITGTIDVRDFGAVGDGVANDTAAIQAAIDFAQSRFKTDYWSTYVPSVRIPAGTYLVRGLTISYPIHLHGDGQNATTL
>PredictedProphage1-Hit4
TAINWREVLFDLRRLDLMPKDVARELRGVISEPSHVRGELILDLWCEKTGKRREDA
>PredictedProphage1-Hit5
LVAALAPIVSRVRTSTCCIKRDGATSNINRPLTNERLAHHVNGGPAYGVYPMQPGSDVTLIALLDLDSHKGETPWHEMQDTAVRIVTVASAAGLNGIPFRSSGGAGIHIYFLWDEPQDAYSARQALRSILAAVDLHDGTKGVAAGQVEIFPKQDSVSHNGYGNMFLLPLAGKSVPLDSFELDDMPKAYVTEMDWPSSAPVPRAEREIVVPPPAVVAPAEFGALKSALDAIPNGGENELDYDSWRNVLFGVHHASQGSDEGLALVHEFSARSSKYDPAKTERDWGYAGKNQGTPITIGTIKAMAAAHGWQDPAREPSEDDFDV
>PredictedProphage1-Hit6
RLTNVLNDIQLRQLVRAGVPAAKADGNGLTFTLSATGTASWILRFYHRGRRQELTLGRYPDITLSAARAMAARKRAQLADGINPAEEQRKLRSRRDWSMRELIADYRVKVLSTLATSTQRSYGRNLKRVENGMGAMSVQSVGPADIVAEIERHDLGWVEIFTLWCVLRGLFKHAAGKKIIVANPCAGIQLDAIIGKRPPVKPRLMLTDDELYVLLNAKMRDVNLYAVRIALATGVRISELYTALRRDLHLSEGRWHVPKSKTGPEMDIPLVPIVIEWFERLLALAGTSEYVLPARLSNRLDRHHGDTHVSKDAIREAIDYWIEHHEPAIRRFTPHDLRSTMKSHMRRLKVPRDISEMCLNHKIPGVEGIYDQYTYWDERRHALGTWAAHLERCARG

Genome file:  temp/burkholderia_strain.txt
Sequence Header:  >Contig24

>PredictedProphage1-Hit1
LDLLHAFVAVAETGSFTAAADVVGRSQSAVSQKVLRLEDALGVRVFERTSRSLRLTQEGERVLAGGRRLLAQYDAFMHELREPPQVERLRLGVSENLVHAQLPRILARFGERFPAVQLELV
>PredictedProphage1-Hit2
LRIFRSVVEMRSFTRAADMHGLARPVVSRAVADLEARFGSRLLHRTTRQVSLTETAERIYERCAAVLDELDSLEAEAQAPTREPEGLLRLVAHTTAALNRLVPLIAGFKAAHPKVRLDVTLTERPIDLVGEGYDIGIVVPYMLTNESTVVRLVERIPLVIVATPTYLRAHSRPVMPADLADHPFVPMSPSLRRPALSFRVDGDLLTVPFRFDISSNSPVFNREMVMHDFGIGVVPKTLVQAELASG
>PredictedProphage1-Hit3
VRDRRVQVAAEPETDQPEHQQRAQAEEARGERIRTERDQLERADRQQRHADLQRAECAHLRKKKRRQEHGHEDPDAGHERQQAADPEVAHDERAQVDDRILRGQRMHDEQEAADAGDPRADHDRVVAEPVLARAFFQHVFEAAEEARHQHDAEIVAALDEAE
>PredictedProphage1-Hit4
MRITPLPPLQCLIAFEAAVRHASFTRAATELHLTQSAISRQIQQLEEFLGRSLFVREHRSLRLTIAGEQYAEQVHRLLTQCAEATHDVMKPYGDLELTIACSSGVALLWLTPRLPEFRAAYPDIKLRLIVRDGLASMSPAEFDVGVYYVRQQAPAEYTARRLFDEEVFPVCAPGYLAGRTLDAADLANETLLRLEDGQRQWMSWSEWFDQNDIDRQKAQPQDITINSYPQIVQMTILGQGISLGWRYMIDACIEAGLLVRVTDASASHGGGYYVISPNDRAQNHAARLFTRWL
>PredictedProphage1-Hit5
IGNGLEWFDFTVYSFFAVIIAKLFFPTGNELTSVLLTVATFGVGFFMRPVGGIVLGIYADKVGRKAALSLTILMMAAGTALIGLAPTYEQAGIAAPLLIVVARLLQGFSAGGEMGGATAFLTEYAPPEKRAYYSSWIQSSIGFAVLLGAATGTFVTTSLDAQALHSWGWRLPFLLGIIVGPVGYFIRSHIDETPAFSAVEAQAKESSPLKEVLSTYPRETFASFSMVILWTVCTYVLLFYMPTYSVRTLHLPQSTGFAAGMVGGLMIMCCSPIVGRLADVWGRRVFLSGSALAIFVLAWPMFAWINHAPGFTSLIVFQAVFGVLIAIYTGPILAAFAELFPTKVLSTGLSVAYNFAVTIFGGFAPFLITWLIARTGSNMAPAFYVTLAAAVSFI
>PredictedProphage2-Hit1
LRHIHYFLAVAEHRSFTRAAAALHVSQPALSQQIRQLEETLGAQLFDRTGRVTRLTDAGDVYFRYARQALHDLAEGRRAIHDVQDLSRGSLRIAVTPTFTSYLVGPLVEAFHGRYPDVTLSVREMSQERIEALLVDDELDVGIAFEDVQTADIEAQTLLVETLALVVNREHAFAGKRKAGLRALHDAPLVLLTAEFATRVQIDRYFREHDVRPRVLMEANSLGAVIEI
>PredictedProphage2-Hit2
AVAETGNMTRAAEAVNRSQSAVSMQIKSLEDAIGRPLFVRKPRSIVLTREGEVLLGFARRMLALRDEAWAAVVRPEVTGKVVIGVPDDYASSLLPSVLKKFSATYPKVEIQVM
>PredictedProphage2-Hit3
KLSSLDPELIRAFVAVVESGGFTAAARQLHRTQSTISLRIRTLEERLDTHLFMRNSRRLELSRDGENFLIHARRIIQVQNDAILALKQASSDRGVVRFGLPEDYAELWLPDLLKSFYAMRPGARLHVHCRMSLELLERLQAGELDVALVVRHGPGAGGRVLGRHDV
>PredictedProphage2-Hit4
MGMIGSSALIGIFFGSLVFGWLSDRMGRQKIFLTSFVIITAAAFAQLFVTSPLELCMLRVLIGFGMGGDFTVGHAILAEFSPRKHRGALLGSFSVIWTIGYVAANVLGLAYSDAAPDAWRWLLASAALPALIVLVLRIGTPESP
>PredictedProphage2-Hit5
LPSLIALRFFEETARHLSFNRAAVSLCVTQGAVSRQIRLLEEALGARLFERDHKGVRLTDAGERLLPFIGQAFDTIERGVGEIAAARPGAKRRLTVSLPPTFATQWFSPRLGTLAEALPDVELSI
>PredictedProphage2-Hit6
MPALNALKAFEMAGRTGSFTRAAELLNVTQSAVSRQVRQLEGQLGETLLERRHHQLELTAAGRVLLRALQQSFDKIELTVRSLQEKTHLNRLRANVPPTFAARWLMPRLGRLRDAHPEFELSLTTRIHDSLGESRVLDCAIRFGDGEWDGFDNALLMQEQHIAVCAPALYARLRQDGAPIDLNRFTLLHVLATDDQRYLTWQHWLKAAGIADVDTRGGYEFDLLDHAIRAAIDGLGITIADRHMVARELATGQLMQVLNVHVDGHQSYWFVTRPEQTNLPHIVQFRDWLQQEV
>PredictedProphage3-Hit1
ERPVDVEVDSEPIELLADERPVDVEVDREPIELFADDKPVEVEVDREPIELLADDRPVEVEVDSESIELLADDKPVEVEVDREPIELLADDKPVEVEVDSEPIELLADDRPVEVEVDSEPIELLADDRPVEVEVDSEPIELLADDRPVDVEVDSDVTELFVELRPVDSEPIELLADERPVDVEVDREPIELLADERPVEVEVDREPIELLADDRPVEVEVDREPIELLADDRPVEVEVDSESIELLADERPVDVEVDREPIE
>PredictedProphage3-Hit2
LADDRPVDVEVDSEVIELLADDRPVEVEVDSESIELLADDRPVDVEVDREPIELLADDRPVDVEVDSEVIELLADDRPVEVEVDSESIELLADDRPVDVEVDSEVIELLADDRPVDVEVDREPIELLADDRPVDVEVDSDVIELLADDRPVEVDVDSDVIELLADERPVEVEVDSEPIELFADDRPVEVDVDSESIELLADERPVEVEVDSEVIELFAEERPVEVEVESEVIELLADERPVEVEVDSDVTELFVDDRPVDVEVDSESIELLADERPVEVEVDSEVIELFA
>PredictedProphage3-Hit3
EVEVDSEPIELLADERPVEVEVDSEVTELFVDDRPVDVEVDSESIELFADDRPVEVEVDSEPIELFAEERPVEVEVDSEVIELFADERPVEVEVDSEVIELFADERPVEVEVDSEVTELFVDERPVEVEVDSEVTELFVDERPVEVEVDSDVTELFVDDRPVDVEVDSESIELLAEDRPVEVEVESEVIELFADDRPVEVEVDSEPIELLADERPVEVEVDSEVTELFVDDRPVDVEVDSESIELLAEDRPVEVEVESEVIELLADDRPVDVEVDSEVTELLVDERPVESEPIELL
>PredictedProphage3-Hit4
VEVDSEVTELFVEDRPVDSEPIELFADDRPVDVEVDSDVTELLVDERPVDSEPIELVADDKPVEVEVDSEVTELLVELRPVDSEPIELLADDRPVEVEVDSDVTELLVELRPVDSEPIELLADERPVEVEVDSEVIELLADDRPVEVEVDSDVTELLVELRPVDSEPIELLADDRPVEVEVDSEVIELLADDRPVEVEVDSDVTELLVDERPVDSEPIELFADDRPVEVEVDSEVIELLADDRPVEVEVDSDVTELLVDERPVDSEPIELFADDRPVEVEVDSEVIELLADDRPVEVEVDSDVTELFVELRPVDSEPIELFADDRPVEVEVDSEVIELLADDRPVDVEVDSDVTELFVELRPVDNEPIELVADDRPVEVEVDSEVIELLADERPVDVEVDSDVTELFVELRPVDSEPIELLADERPVEVEVDSEVIELLADERPVDVEVDSEVTELLVDERPVDSEPIELLADERPVEVEVDSDVTELLVDERPVDSEPIELV
>PredictedProphage3-Hit5
SGVSNVSTGAANSATNNGYNASAGADGTNANIAIGTVATAGGFGSTAIGDTTTASGQGSTAIGNMSTASGAQGTALGNSAKATNSQTTAIGYAATASGNGAMAVGYGATASNSQSTAIGAGASSTGSGSVALGNGSTDGGQSNVFSVGNSTTQRRIVNVAPGTVSSTST
>PredictedProphage4-Hit1
YRYKSPIDDRMRQVKLGEWPAMGFPAAIAEWERKRSDRDAGADPAAAKREKRTAVAISRAVDAYTVKQVCFDYMGGYLEPNRKDKGVVEVRRMFKAMLGPIETVAAASITRAQAFEFLDSFRATPALAARLRMELGGAWDYAMDAGRLPDGTPNWWRMILRGKLRSKGRTIDGVAMGTKKRVLSEDEVGTLLRWLPNMSLTVSDAITLYLWTGARGGEIISMEAHEIADESDGLWWTVPKEKTKNSWRSKAGDLRVPITGRAEAIVRRRKEQAVNGFLFPTSTGEMMKQTVISHGVYYHQPYCKQAPNHNRPRLTVTHWSPHDLRRTARTMLAALGCPHDVAEAVLGHIQPGVAGVYNRHHYDRERREWLTRLGQFLD
>PredictedProphage4-Hit2
YLDLPAVATALSLSEATVQKLVRENKFPKPRLLSDRRVAWLTREVEAW
>PredictedProphage4-Hit3
MQKKFVMRGYEMNCEPRVTEDGKYAAQVEVTKLGFSREAAFRNLGEFDSETKAVDYARQFSVEWLSRYG
>PredictedProphage4-Hit4
MAVYVDDMYRHEIGKLGRMKMSHLIADTTEELLAMVREIGVNPKWIQHPGTRDEHFDIAISKRAAAIAAGAIPVTFRQCGAMNKRRKVTGSLGSPTDAIEWLERFVAERR
>PredictedProphage4-Hit5
MSQTARDLLELRRDRPFSDELRRLALNLIAPGVASAHGGC
>PredictedProphage4-Hit6
VSGATPFLGHTVEPPGCSLAG
>PredictedProphage4-Hit7
HGELRDADLPDWLPRDAWLDWCEHREAKEKKADVPWTRPAAKVTIKKLAKLHEDGRDVVAAIEESVLRGWTGIWEAKDGAATGSGVSAVPSNWHKSNTGVTEHGKRLGVTQKDGEVFMRFKARVVKAAGPGEWMEEMLRDAARFGDEQYEGLYRYFNDIP
>PredictedProphage4-Hit8
VSEVACIELSSVPAPLRAIAASRVDAASGDRLVAFTGCPVIGREADNGEIEFSFPRGVDLRESLIDWMLYWGIPFRVM
>PredictedProphage4-Hit9
QHPKGGALARLAGLWANEPEFLDWMRSIGQPANTPVDAAEFVRARCCIESRAQLDHDPRAKARFEQYVRGPYAKYRAAAG
>PredictedProphage4-Hit10
PPPKLTLSEWADKYAVLSRETSAQTGRFRAFPYQNGIMDAVTDPTVETITVQKSARVGYTKILDHVAGYFIHQDPSPMLVVQPRVEDAEDYSTTEIEPMLRDTPVLAEIVGDLKRKDAKQKILKRVYRNGASTSFVGANSPGGFRRITARIVAFDEVDGYPVQGAGKEGDQIKLGIKRTESFWNRKIILGSTPTVKGFSRIEKSFENSDQRRYHVPCPHCGEFQVLEWGGPDTPHGMKWDKDADGVGLPETAYYVCRHNGCIIHDVDKPDMVERGEWRAAKPFAGHAGFHIWAGYSLFPNASWRNLVKEWLEVKDDPLARQTFINLVLGETYEDRSDRALKEDRLAARAEVWSAEVPDGVAVLTAGVDTQGDRFEVEVIGWGRNEESWSVAYEVIEGDMETPDPWDRLDGFLQRIWHRADGRGFEIMAVCHDSGGNHTQKVYEFSKARLGRRIWAIKGESAVAGKRNPVWPTKKPTRKTRASFRPVIIGVNAAKDTIRNRLHVDAPGPGYMHFPTDRDINYYAQLTAERQVRKVSGGQVYKVWELPRGRTNEALDCRVYGYA
>PredictedProphage4-Hit11
SQTPYDAANLYGAHVEDWNPYLWSPDGEINMYHDRITARARDLVRNDGWATAAVMRTLDNVIGPDFRPISKPDHVALRALTGNKAFDHVWADEFGQQVEANYRAWAHDPGFYCDAERMLPMPGLFQVAFRHKIVDGDGLGQMHYLPQRVSVGRARYATAHQVIDPD
>PredictedProphage4-Hit12
AQYRLPRGLLDSVWTVESGRGANMLSPKGAMGHFQFMPATAKQYGLTDPNDLQQSATAAARMYSDLLKANGGDLERALAGYNWGQGNLNRAGLGAAPNETRKYIAAVEAN
>PredictedProphage4-Hit13
PIFSRMHKLGDEKRAVVILHPDDWEEWLTTSNVEAARAMLQLYPADEMMDEP